Bộ gen Virus_corona_liên_quan_đến_hội_chứng_hô_hấp_cấp_tính_nặng

Tổ chức bộ gen của SARS-CoV

Virus corona liên quan đến SARS là một virus có màng bọc, ARN chuỗi đơn dương. Bộ gen của nó dài khoảng 30 kb, thuộc hàng lớn nhất trong số các virus ARN. Virus có 14 khung đọc mở có thể chồng gối nhau trong một số trường hợp.[20] Bộ gen virus có một đầu 5′ methylate và đuôi 3′ polyadenylate.[21] Có 265 nucleotit trong vùng 5' UTR và 342 nucleotide trong vùng 3' UTR.[20]

Đầu 5′ methylate và đuôi 3′ polyadenylate cho phép bộ gen ARN dương được trực tiếp dịch mã bởi ribosome của tế bào chủ khi virus xâm nhập.[22] SARSr-CoV tương tự các virus corona khác ở điểm quá trình biểu hiện gen được bắt đầu bằng việc ribosome của tế bào chủ dịch mã hai khung đọc mở (ORF) chồng gối lớn đầu tiên, 1a và 1b, cả hai đều sinh ra các polyprotein.[20]

Chức năng các protein di truyền của SARS-CoV (orf1a tới orf9b)
ProteinChức năng[23][24][25]
orf1a,
orf1b		Polyprotein sao chép/phiên mã (pp1ab)
(proten phi cấu trúc)
orf2Protein gai (S), liên kết virus và xâm nhập
(protein cấu trúc)
orf3aTương tác với các protein cấu trúc S, E, M;
Hoạt động kênh ion;
Tăng cường các cytokine và chemokine như IL-8 và RANTES;
Tăng cường NF-κB và JNK;
Thúc đẩy chết rụng tế bào và gián đoạn chu kỳ tế bào, thông qua Caspase 8 và -9,
và bởi Bax, p53, và kinase p38 MAP
orf3bTăng cường các cytokine và chemokine bởi RUNX1b;
Ức chế sản sinh và truyền tín hiệu IFN loại I;
Thúc đẩy chết rụng tế bào và gián đoạn chu kỳ tế bào;
orf4Protein màng bọc (E), lắp ráp và nảy chồi virus
(protein cấu trúc)
orf5Protein màng (M), lắp ráp và nảy chồi virus
(protein cấu trúc)
orf6Tăng cường tổng hợp ADN tế bào;
Ức chế sản sinh và truyền tín hiệu IFN loại I
orf7aÚc chế tổng hợp protein tế bào;
Thúc đẩy phản ứng viêm bởi NF-kappaB và promotor IL-8;
Tăng cường các chemokine như IL-8 và RANTES;
Tăng cường JNK, kinase p38 MAP;
Thúc đẩy chết rụng tế bào và gián đoạn chu kỳ tế bào
orf7bChưa biết
orf8aThúc đẩy chết rụng tế bào thông qua ty thể
orf8bTăng cường tổng hợp ADN tế bào
orf9aProtein vỏ bọc nhân (N), vỏ bảo vệ ARN virus
(protein cấu trúc)
orf9bThúc đẩy chết rụng tế bào

Một vài protein virus đã xác định được chức năng.[26] Các ORF 1a và 1b mã hóa polyprotein sao chép/phiên mã, và các ORF sau 2, 4, 5, và 9a lần lượt mã hóa 4 loại protein cấu trúc: gai, màng bọc, màng và vỏ bọc nhân.[27] Các ORF sau cũng mã hóa 8 loại protein đặc trưng (orf3a tới orf9b), gọi là protein phụ (accessory protein), nhiều loại chưa tìm ra được các đồng đẳng. Chức năng của các protein phụ hiện chưa được hiểu rõ.[26]